药物治疗如：非类固醇的抗炎症药物可以使症状得到缓解。口服避孕药也有效，黄体素也有一定疗效。Danazol(疗得高)可以阻断子宫腺肌症组织的芳香酵素活性，服药期间月经会暂停，因此不再痛经，持续吃药三个月到六个月就可以使子宫肌层变薄，子宫也变小，但是此要为男性荷尔蒙衍生物，长期服用可能会出现声音低沉、青春痘、长胡子等副作用。
子宫腺肌病者子宫肌层中的内膜病灶与宫腔面的子宫内膜有些直接相连，故一般认为多次妊娠和分娩时子宫壁创伤和慢性子宫内膜炎可能是导致此病的主要原因。此外，由于子宫内膜基底膜下缺乏黏膜下层，且子宫腺肌病常合并有子宫肌瘤和子宫内膜增生过长，故有者认为基底层子宫内膜侵入肌层可能与高雌激素刺激有关。
传统的治疗方法是手术，以摘除子宫或卵巢为代价。切除子宫不仅可造成血糖，血脂增高，内分泌功能紊乱，更年期症状加重等症状，而且术后复发率高。药物治疗可抑制异位内膜生长或不进展,但停药后复发率很高.所以最理想的治疗方法是超声引导下细针穿刺中药热凝剂介入治疗子宫腺肌瘤的方法。
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