巧克力囊肿一般是需要做手术来治疗，才能达到彻底根治。
巧克力囊肿也叫做卵巢子宫内膜移位囊肿，是属于子宫内膜移位后引起的一种疾病，在子宫内膜移位后，可能会影响正常月经周期出血，在出血之后不能及时排出，有可能会在子宫内淤积，还会形成囊肿，出现巧克力囊肿，需要及时到医院做检查，最好在医生指导下通过微创手术的治疗，可以将局部切除来达到彻底根治。
在手术治疗巧克力囊肿后，还需要做好护理，在短时间内不可以有性生活。
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